Isomorphic Labs 的下一代 IsoDDE 引擎推進了複雜和難以靶向分子的 AI 驅動設計

同構實驗室Google DeepMind 的衍生公司推出了 IsoDDE，據稱它是截至 2026 年 2 月最先進的公開披露的用於計算藥物設計的 AI 系統。 

該平台定位為全週期電腦模擬引擎，超越了 AlphaFold 3 的結構預測重點，旨在解決數位藥物開發工作流程中幾個長期存在的限制。 

據該公司稱，IsoDDE 旨在推廣到不熟悉的生物系統，無需依賴傳統的基於物理的模擬即可預測結合親和力，識別隱藏的調控口袋，並能有效地與抗體和其他複雜的生物分子一起運行。

Isomorphic Labs公司報告稱，其內部項目已將IsoDDE用於解讀先前未表徵的結構、檢測尚未通過實驗註釋的口袋，以及為被認為難以成藥的靶點生成新的化學物質。該系統被定位為一個統一的計算框架，旨在彌合結構預測與實際藥物設計任務之間的差距，其準確率據稱超過了以往基於深度學習和物理學的方法。

自 2024 年 AlphaFold 3 發布以來，人工智慧分子建模領域取得了快速發展，IsoDDE 平台正是在此背景下開發的。儘管 AlphaFold 3 模型顯著提升了蛋白質-配體結構預測能力，但它並未完全解決將計算方法應用於實際藥物研發流程的挑戰。在實際藥物研發流程中，模型必須處理各種不同的生化特性，並能外推到訓練分佈範圍以外的系統。 IsoDDE 旨在彌合這一差距，提供一個可擴展的基礎架構，使其能夠探索生物和化學空間中未知的領域。

Isomorphic Labs表示，其IsoDDE平台已與多家大型製藥公司合作，該平台負責進行電腦輔助設計和預測，而合作夥伴則負責實驗驗證和臨床開發。該公司也持續拓展其內部研發管線。在2025年至2026年間，該公司獲得了大量投資，其中包括2025年3月完成的6億美元融資，並正在準備多個自主研發的分子藥物（主要針對腫瘤領域）進入臨床試驗。

IsoDDE 被譽為下一代計算引擎，旨在提高預測準確性，擴大可成藥靶點的範圍，並加速從分子建模到實驗驗證的治療候選藥物的轉變。

IsoDDE 為人工智慧驅動的藥物設計樹立了新的標桿

IsoDDE 被描述為預測準確性和功能範圍的重大進步，它提供了對控制人類生物學的分子系統的更詳細了解，並改進了旨在影響這些分子系統的化合物的計算設計。 

據報導，在 Isomorphic Labs 正在進行的研究項目中，該平台被常規用於解釋以前未表徵的結構，檢測未通過實驗識別的口袋，以及產生旨在挑戰治療靶點的新化學物質。 

該公司表示，將繼續致力於拓展電腦輔助藥物設計的邊界，旨在將這些增強的能力應用於歷史上被證明難以實現的藥物發現領域。